影響運輸成本的因素是多樣化、綜合性的，這就要求對運輸成本的分析要采用系統(tǒng)的觀點，進(jìn)行綜合分析。在控制物流運輸成本的過程中，也要進(jìn)行綜合治理，多管齊下。

要樹立現(xiàn)代物流理念，引進(jìn)先進(jìn)的物流運輸管理和優(yōu)化方法，結(jié)合企業(yè)自身實際，尋找改善運輸管理，降低運輸成本的最佳途徑。健全物流管理體制，建立物流運輸管理專職部門，實現(xiàn)物流管理的專門化。應(yīng)用物流作業(yè)成本法（物流ABC），把反映物流運輸成本的數(shù)據(jù)從財務(wù)會計的數(shù)據(jù)中準(zhǔn)確剝離出來，統(tǒng)一企業(yè)成本計算的口徑。在提高物流服務(wù)水平的同時，加強預(yù)算管理，強化成本管理意識，實行定額管理和目標(biāo)成本管理，進(jìn)行成本控制目標(biāo)分解，明確責(zé)任，實現(xiàn)責(zé)、權(quán)、利結(jié)合，加強成本核算和考核。

運輸成本占物流總成本和銷售額比例較大，凸顯了運輸成本管理的重要性。對運輸成本的控制并不是哪一個或幾個部門、哪幾個工作人員或哪幾個工作崗位就能完成的，而是需要以物流管理部門為主導(dǎo)，物流運輸乃至于整個物流功能環(huán)節(jié)及所涉及到的各個部門、所有人員的共同配合，科學(xué)規(guī)劃和協(xié)調(diào)，做到人人關(guān)心成本管理，全員參與成本控制，共同降低物流運輸成本和物流總成本。

運用系統(tǒng)觀點不斷優(yōu)化運輸資源配置，提高管理技術(shù)和手段的運用，提高企業(yè)運輸管理水平，樹立物流戰(zhàn)略成本管理的理念，追求整個供應(yīng)鏈、整個流通過程的物流運輸成本最小化，不斷發(fā)掘運輸成本降低潛力，持續(xù)降低物流運輸成本水平。

物流運輸不是一個孤立的環(huán)節(jié)，在組織運輸時，要對運輸活動及涉及到的其他環(huán)節(jié)要科學(xué)規(guī)劃，統(tǒng)籌安排，盡量壓縮不必要的環(huán)節(jié)，減少個別環(huán)節(jié)所占用成本。對有條件直運的，應(yīng)盡可能采取直達(dá)運輸，減少二次運輸。同時，更要消除對流及隱含運輸、迂回運輸、重復(fù)運輸、過遠(yuǎn)運輸?shù)炔缓侠憩F(xiàn)象。

合理選擇運輸工具。在目前多種運輸工具并存的情況下，必須注意根據(jù)不同貨物的特點及對物流時效的要求，對運輸工具所具有的特征進(jìn)行綜合評價，以便作出合理選擇運輸工具的策略，并盡可能選擇廉價運輸工具。

合理選擇運輸方式。要合理組織多式聯(lián)運。采用零擔(dān)湊整、集裝箱、捎腳回空運輸?shù)确椒?，擴(kuò)大每次運輸批量，減少運輸次數(shù)。采用合裝整車運輸、分區(qū)產(chǎn)銷平衡合理運輸、直達(dá)運輸、“四就”直撥運輸?shù)群侠磉\輸形式，有效降低運輸成本。

提高運輸工具技術(shù)裝載量。改進(jìn)商品包裝，改善車輛的裝載技術(shù)和裝載方法，對不同貨物進(jìn)行搭配運輸或組裝運輸，可以使同一運輸工具裝載盡可能多的貨物，最大限度利用運輸工具的裝載噸位，充分使用裝載容積，提高運輸工具的使用效率。對有條件的貨物，開展托盤運輸。

在運費、運距及生產(chǎn)能力和消費量都已確定的情況下，可充分運用運籌學(xué)、管理數(shù)學(xué)中的線性和非線性規(guī)劃技術(shù)、網(wǎng)絡(luò)技術(shù)等解決運輸?shù)慕M織問題，制定科學(xué)合理的運輸計劃和方案。

配送是運輸在功能上的延伸，主要服務(wù)于支線運輸。通過效率化的配送，提高物流規(guī)模效益，實現(xiàn)共同配送也可以降低物流運輸成本。選擇最佳配送手段，實現(xiàn)車輛運行的效率化，從而降低配送成本。同時也提高了供應(yīng)保證程度，降低了庫存成本，進(jìn)而降低物流總成本。